Сейчас спецом проверил, сделал другой ящик [так как другой компьютер] и пошарил еще.
Видимо надо выключить синхронизацию, выключил и действительно заливая на яндекс диск в интернет, на компьютере эта папка не появляется
Короче, суть в следующем - как только выполнил все условия Яндекса, получил бесплатно 10 Гб, удаляй программу Яндекс.диск с компьютера. (файлы заливаешь через интернет). Больше ничего не синхронизируется, файлы не теряются.